Layers of Fear не томит игрока долгими отступлениями, а почти сразу же передает ему управление. Итак, мы оказываемся в прихожей собственного дома. Поскольку главный герой является выдающимся художником, который к тому же имеет незавершенную картину, нам первым делом следует заглянуть в мастерскую. Находится она возле парадной двери, а ключ от нее лежит на столе в кабинете, что на втором этаже поместья. Попав в комнату, снимаем с холста покрывало, после чего покидаем помещение. С этого момента архитектура дома начинает ненормально изменяться, так что, выйдя из мастерской, мы оказываемся в совершенно ином месте. Проходим коридор и заходим в комнату. Там подходим к окну, а после того, как оно самостоятельно закроется, покидаем помещение.
Очередной коридор приводит нас в очередную комнату, где особо интересно выглядит сундук, что стоит возле стола. Чтобы его открыть, нужно свечами осветить картины в углу комнаты, на которых будет изображена комбинация для кодового замка (генерируется случайным образом). Открываем сундук, забираем содержимое и заходим в появившуюся дверь. Очутившись в гостиной, подходим к висящей на стене кукле. Внезапно мы оказываемся в подвале. В кромешной темноте обнаруживаем горящую свечу, а рядом с ней лестницу, ведущую обратно в гостиную. Поднимаемся и выходим из комнаты. Проходя по коридору до очередной двери, со стены упадет картина. Поднимаем ее, читаем найденную на ней записку и входим в комнату. Там подходим к камину, вызываем жуткий скример и покидаем помещение. Без лишних сложностей проходим следующий коридор и кладовую, после чего попадаем на кухню. Идем к двери со связкой чеснока, потом к картине. Побродив некоторое время, вновь направляемся к двери, а после — опять к картине, на которой подбираем вырезку кожи. Затем спокойно покидаем помещение. Снова мы оказываемся в мастерской. Подходим к картине, дополняем композицию и выходим из комнаты.
Заходим в лифт и активируем его, отклонив рычаг в правую сторону и закрыв решетку. Поднявшись наверх, заходим в ближайшую дверь, берем с тумбы ключ и выходим. После очередного изменения архитектуры следующей нужной комнатой вновь является ближайшая к лифту. Далее без особых сложностей проходим коридор, чердак, еще парочку коридоров, гостиную и, не поверите, еще коридоры. В конечном итоге, мы окажемся в комнате с глобусом, напротив которого будет стоять зеркало. Заходим в отражение и покидаем помещение. Следующий сюрприз ожидает нас в длинном коридоре. Дойдя до его конца, открываем дверь и обнаруживаем за ней картину. Поворачиваемся назад, подходим к аналогичной размером меньше, а затем вновь разворачиваемся. Далее заходим в дверь, что слева, преодолеваем коридор и попадаем в комнату, где подбираем ключ. После того, как дверь захлопнется, зажигаем свечи и дожидаемся, пока нам позволят выйти. Спустя пару коридоров мы оказываемся в спальне с граммофоном. Берем лежащую рядом пластинку, вставляем в устройство и устанавливаем его на отмотку (рычажок сзади). Вместе с музыкой начнет изменяться комната, посему нам нужно дождаться окончания композиции, дабы затем подобрать с пола возле кровати пузырек с кровью. Далее переключаем рычажок, воспроизводим музыку в прямом направлении и ждем восстановления комнаты, после чего ее покидаем. В скором времени мы окажемся в мастерской, где нужно будет нанести еще пару штрихов на картину.
Выйдя из рабочей комнаты в коридор, идем в дверь, что справа. После того, как проход будет перекрыт фортепиано, возвращаемся обратно, где мы в скором времени попадем в закрытый участок коридора. Покрутившись пару раз, появится темный проход. Доходим до тупика, после идем в обратном направлении, где обнаруживаем висячую куклу с ключом. Подбираем его и вновь ступаем обратно до тупика. Там мы окажемся в маленькой спальне. Открываем ключом сундук, стоящий возле кровати, читаем записку и покидаем помещение. Далее, преодолев пару участков злосчастного дома, мы очутимся в замкнутом коридоре. Сначала идем в прямом направлении, пока не наткнемся на разбитый телефон. После того, как он словно в перемотке восстановится, продолжаем путь в ту же сторону. Далее мы неким образом попадем уже на второй этаж, откуда и упал этот телефон. Тут уже необходимо идти в обратном направлении до тех пор, пока мы вновь не окажемся внизу. А повернув затем еще раз, зацикленный коридор, в конечном итоге, соизволит нас выпустить. Вскоре мы попадем в темный кабинет, где мы будем разгуливать по потолку. Включаем свет (переключатель находится возле двери) и покидаем комнату. Далее проходим погреб, пару коридоров (в одном из них нужно расчистить заваленный проход) и оказываемся в итоге в подвале. Там подходим к фортепиано, нажимаем клавишу и поднимаемся обратно до двери. Активируем выключатель возле нее и вновь идем к инструменту, где подбираем коробочку с человеческой костью, а после идем к выходу, коим окажется мастерская.
Пройдя по коридору и повстречавшись с некой барышней, мы попадаем в пустую комнату. Поочередно открываем каждую из дверей, после дожидаемся окончания психоделической сцены и выбираемся оттуда. Далее мы окажемся в комнате, в которой в какой-то момент одна из стен станет нарисованной. После этого момента нужно выйти из помещения. Спустя пару коридоров мы окажемся в зацикленной детской. Спокойно идем по кругу до тех пор, пока дверь перестанет поддаваться. В этот момент дергаем ручку, поворачиваемся, наблюдаем сценку и так повторяем пару раз. В следующей комнате на нас обрушится очередная галлюцинация главного героя (с куклами). Если в какой-то момент в помещении ничего не будет происходить, пробуем подойти к картине. По окончании трипа встаем у окна и оборачиваемся. Оказавшись с длинном коридоре, идем по прямой до третьего поворота и сворачиваем туда. В скором времени мы окажемся в еще в одной детской. На месте заводим игрушку, стоящую на подоконнике, затем подбираем ключик, лежащий в комоде, и запускаем карусель. Затем вновь наблюдаем галлюцинацию, по завершении которой подбираем с кровати пучок волос и выходим из комнаты. Оказавшись в мастерской, как обычно, используем находку.
Выйдя из мастерской, мы вновь окажемся в зацикленном помещении. Идем по правую сторону до тех пор, пока не появится стол и не погаснет свет. Тогда заходим в открывшуюся дверь и включаем лампу, когда вновь потемнеет. Далее спокойно выходим в коридор, пройдя по которому, мы наткнемся на уже упомянутую барышню. Нам ничего не остается, как подойти к ней. После изнурительной встречи мы пробуждаемся в совершенно ином месте. По дороге в куче мусора подбираем ключ и отпираем им дверь. Далее в узком проходе следуем за крысой, пока не дойдем до тупика. Чтобы вернутся обратно, потребуется подобрать комбинацию для внезапно появившегося замка на двери. Для этого находим в помещении листок, на котором изображены цифры и названия животных. Выбираем нужного зверя (по изображению), а после, следуя по исходящим от него маршрутам, определяем код. Выбравшись из западни, идем по коридору и вновь утыкаемся в тупик. Возвращаемся обратно к комнате с загадкой, а затем снова идем назад. Далее ступаем вперед до узкого прохода, в котором мы провалимся вниз. Очнувшись, продолжаем шествие по вездесущим коридорам, один из которых приведет нас к гостиной с огромной картиной. Подходим к ней, пару раз оборачиваемся, а после дожидаемся окончания галлюцинации. Пройдя еще пару коридоров, мы окажемся в помещении, где наверху появится зловещая надпись: «Не оборачивайся». Не прислушавшись к наставлению, герой вновь потеряет сознание. После пробуждения мы вскоре попадем в подвал с необычной дверью. Открываем ее, опуская цепь, что свисает посреди помещения. Далее мы очутимся в очередной комнате классического образца (картины, кресла, камин). Щелкаем выключатель возле двери, вырубаем лампу и выходим в боковую дверь. Пройдя немного вперед, заходим в лифт и активируем его по знакомой схеме. В один момент он застрянет, а после рухнет вниз. Придя в себя, обнаруживаем вокруг четыре решеточных двери. Отодвигаем каждую из них в сторону, а затем смотрим наверх. Далее проходим вперед по знакомому коридору и натыкаемся на каморку, где сидит женщина. Что ж, снова подходим к ней.
После пробуждения мы вскоре попадем в просторный кабинет. Спустя некоторое время зазвонит телефон, который потребуется найти. Для этого отодвигаем красную книгу на шкафу справа. Обнаружив телефон и ответив на звонок, нам нужно будет перезвонить. Необходимый номер появится на картине, что висит в центре помещения, однако перед этим потребуется осмотреть содержимое стола. Вбив номер, зазвонит еще один телефон. Становимся посредине кабинета, смотрим наверх, а после идем в появившуюся дверь (находится за первым найденным телефоном). Пройдя по коридору, мы окажемся уже наверху комнаты. Идем по узкому выступу вправо до конца и находим телефон. Номер от него будет нарисован на шкафу, который свалится позади нас. Вбив номер, мы окажемся на противоположной стороне. Снова проходим по выступу, открываем дверь и обнаруживаем телефон, номер от которого будет изображен на картине, находящейся на другой стороне. После звонка идем по поддонам до еще одного аппарата и благополучно проваливаемся вниз. Очнувшись, отвечаем на звонок последнего телефона и подбираем отрезанный палец, который несем в мастерскую.
Покинув мастерскую, доходим до комнаты с тремя жуткими картинами. После того, как они повалятся на пол, становимся в центре между ними, дожидаемся очередного приступа протагониста и благополучно выходим. Далее в узком проходе встречаем старую знакомую, от которой на сей раз следует держаться подальше. Вернувшись в комнату, идем в соседнюю дверь. Попав в размалеванный тупиковый коридор, находим возле картины дверь в полу и прыгаем вниз. Чуть позже мы окажемся в техническом помещении, где нужно будет краном вытащить со дна связку картин. Далее пара-тройка коридоров приведет нас к ванне, в которую придется погрузиться, зажав и не отпуская клавишу действия. Завершив купания, подбираем банку с человеческим глазом и выходим.
Затем нас ожидает финальная головоломка игры. Задача: найти разбросанные по всему помещению шашки. Первые две находятся аккурат напротив доски (спереди и сзади). Подобрав их, подходим к игральному месту (делать это необходимо после обнаружения каждой шашки) и генерируем новый участок комнаты (детскую). Там шашка будет лежать на креслице. Далее появится спальня. Идем туда и дожидаемся, пока через окно не повалится куча женских аксессуаров. Затем смотрим наверх, видим кровать, а после шашку, которая на наших глазах упадет вниз. Следующие две шашки находим в ванной комнате. Одна из них будет лежать на верхней ступеньке, вторая – на комоде возле унитаза. На появившейся кухне шашка валяется на весах, но чтобы ее подобрать, нужно поставить на них грузик, который лежит в шкафчике возле большого чана. Далее заходим в кабинет, а после того, как заиграет музыка, подходим к игральной доске. Снова мы оказываемся в мастерской, где и наносим финальные штрихи на картину. После скриптового ролика мы обнаруживаем себя в доме с нормальной архитектурой. Как и в начале игры, идем в кабинет, берем со стола ключ и идем в мастерскую, где вновь снимаем покрывало с картины. Игра пройдена.